Bagaimanakah serbuk IPTG mempengaruhi ekspresi protein dengan penggunaan kodon yang berbeza?

Hey! Sebagai sebuahSerbuk IPTGpembekal, saya telah setinggi lutut dalam dunia ekspresi protein. Dalam blog ini, saya ingin bersembang tentang bagaimana serbuk IPTG memberi kesan kepada ekspresi protein dengan penggunaan kodon yang berbeza.

Serbuk Iptg

Kod Produk: BM-2-5-133
Nama: Iptg
Nombor CAS: 367-93-1
MF: C9H18O5S
MW: 238.3
Nombor EINECS: 206-703-0
Pasaran: Indonesia, UK, New Zealand, Kanada dll.
Pengeluar: BLOOM TECH Kilang Guangzhou
Perkhidmatan teknologi: R&D Dept.-4
Penghantaran: Penghantaran sebagai satu lagi nama sebatian kimia yang tidak sensitif.

 

Mula-mula, mari kita semak apa itu IPTG. IPTG, atau Isopropyl β-D-1-thiogalactopyranoside, ialah bahan kimia yang terkenal dalam bidang bioteknologi. Ia adalah analog allolactose, yang merupakan inducer semula jadi operon lac. Secara ringkas, ia boleh menghidupkan gen yang bertanggungjawab untuk pengeluaran protein dalam bakteria tertentu, seperti Escherichia coli.

 

Sekarang, apabila bercakap tentang ekspresi protein, penggunaan kodon memainkan peranan yang besar. Organisma yang berbeza mempunyai keutamaan mereka sendiri untuk kodon (set tiga nukleotida) yang mereka gunakan untuk mengekod asid amino. Sebagai contoh, sesetengah organisma mungkin menggunakan kodon tertentu untuk asid amino tertentu dengan lebih kerap daripada yang lain.

Mari kita mulakan dengan melihat kodon frekuensi tinggi. Protein yang dikodkan oleh gen dengan kodon frekuensi tinggi biasanya lebih mudah untuk dinyatakan. Apabila kami memperkenalkan serbuk IPTG ke dalam sistem bakteria yang mengekspresikan protein sedemikian, proses itu boleh berjalan dengan lancar. IPTG mengikat kepada protein penindas operon lac, melepaskannya dari kawasan pengendali. Ini membolehkan RNA polimerase untuk mengikat kepada promoter dan mula menyalin gen yang kod untuk protein.

 

Dalam bakteria seperti E. coli, yang sangat biasa dalam sistem ekspresi protein, gen dengan kodon frekuensi tinggi dikenali oleh ribosom dengan cepat. Ribosom boleh menterjemahkan mRNA ke dalam protein dengan cekap. Apabila kami menambah IPTG, kami pada asasnya memberi bakteria lampu hijau untuk memulakan proses pengeluaran ini dengan pantas. Jadi, untuk protein dengan penggunaan kodon frekuensi tinggi, serbuk IPTG boleh membawa kepada ekspresi protein tahap tinggi dan cekap.

 

Tetapi bagaimana dengan kodon frekuensi rendah? Perkara menjadi lebih rumit di sini. Gen dengan kodon frekuensi rendah mungkin tidak dapat dikenali dengan mudah oleh ribosom dalam perumah bakteria. Apabila IPTG ditambah untuk mendorong ekspresi protein dengan kodon frekuensi rendah, ribosom mungkin terhenti semasa terjemahan. Ini kerana mereka mempunyai masa yang lebih sukar untuk mencari tRNA yang sesuai (RNA pemindahan) yang membawa asid amino yang sepadan untuk kodon frekuensi rendah tersebut.

Akibatnya, tahap ekspresi protein keseluruhan boleh lebih rendah berbanding dengan protein dengan kodon frekuensi tinggi. Kadangkala, kita mungkin melihat protein yang tidak lengkap atau tersalah lipat. Terhentinya ribosom juga boleh menyebabkan tekanan pada sel bakteria, yang boleh menyebabkan pertumbuhan dan daya maju sel berkurangan.

Untuk mengatasi masalah ini, kita boleh menggunakan beberapa helah. Satu pendekatan adalah untuk menyatakan bersama gen tRNA yang mengenali kodon frekuensi rendah. Ini boleh membantu membekalkan ribosom dengan tRNA yang diperlukan, membolehkan terjemahan yang lebih cekap. Pilihan lain ialah mengoptimumkan jujukan gen itu sendiri. Kita boleh menggantikan kodon frekuensi rendah dengan kodon frekuensi tinggi yang kod untuk asid amino yang sama. Proses ini dipanggil pengoptimuman kodon.

Mengenai serbuk IPTG kami, kami telah memastikan ia berkualiti tinggi. Pelanggan kami telah melaporkan hasil yang hebat dalam eksperimen ekspresi protein mereka. Sama ada untuk protein dengan kodon frekuensi tinggi atau frekuensi rendah, IPTG kami boleh mendorong proses ekspresi dengan berkesan.

Sekarang, izinkan saya memperkenalkan beberapa produk kimia lain yang menarik yang kami berurusan. Semak keluarHalofuginone Hydrobromide. Ia mempunyai beberapa sifat unik dan aplikasi yang berpotensi dalam bidang penyelidikan. Dan juga,Serbuk Estrone CAS 53-16-7adalah satu lagi produk yang menjadi perhatian penyelidik kami. Dan kami juga ada(4S,5R)-(-)-4-METHYL-5-PHENYL-2-OXAZOLIDINONE CAS 16251-45-9yang boleh menjadi tambahan yang berharga kepada bekalan penyelidikan anda.

Jadi, jika anda terlibat dalam penyelidikan ekspresi protein atau memerlukan bahan kimia berkualiti tinggi untuk percubaan anda, jangan teragak-agak untuk menghubungi kami untuk perbincangan pembelian. Kami di sini untuk membantu anda mendapatkan hasil yang terbaik dengan produk kami.

[1] Pengkaji, FW, & Moffatt, BA (1986). Penggunaan bacteriophage T7 RNA polymerase untuk mengarahkan ekspresi peringkat tinggi terpilih bagi gen klon. Jurnal Biologi Molekul, 189(1), 113-130.
[2] Gustafsson, C., Govindarajan, S., & Minshull, J. (2004). Bias kodon dan ekspresi protein heterolog. Trend dalam Bioteknologi, 22(7), 346-353.